ТОО «Казахский научно-исследовательский ветеринарный институт»:
Лаборатория бактериологии;
Лаборатория вирусологии;
Лаборатория бруцеллеза;
Лаборатория паразитологии и микологии;
Лаборатория молекулярной генетики и пищевой безопасности;
Отдел биолого-технологического контроля с депозитарием.
АО «Научный центр противоинфекционных препаратов»:
Лаборатория иммунологии;
Лаборатория микробиологии;
Лаборатория вирусологии;
Контрольно-аналитическая лаборатория;
Лаборатория фармакологии и токсикологии;
Лаборатория фармацевтической химии и фармацевтической технологии;
ТОО «Национальный центр биотехнологии» г. Астана:
Лаборатория иммунохимии и иммунобиотехнологии;
Лаборатория биотехнологии и селекции растений;
Лаборатория генетики и биохимии микроорганизмов;
Лаборатория стволовых клеток;
Лаборатория токсикологии и фармакологии;
Национальная научная лаборатория биотехнологии коллективного пользования;
Лаборатория генетической инженерии растений;
Лаборатория биоразнообразия и генетических ресурсов;
Лаборатория геномики растений и биоинформатики;
Лаборатория протеомики и масс-спектрометрии;
Лаборатория генетической инженерии;
Лаборатория прикладной генетики;
Лаборатория генетики человека;
Лаборатория молекулярной биотехнологии.
Филиал ТОО «Национальный центр биотехнологии» в г. Алматы:
Лаборатория молекулярной биологии;
Лаборатория экспертизы и диагностики;
Лаборатория иммунологии и иммунобиотехнологии;
Отдел биобезопасности и биозащиты;
Отдел инноваций и разработок;
Референтный центр по секвенированию и геномному анализу возбудителей опасных и особо опасных.
Филиал ТОО «Национальный центр биотехнологии» в г. Степногорск:
Лаборатория прикладной биотехнологии;
Лаборатория биопрепаратов;
Лаборатория микробиологии.
ТОО «Республиканская коллекция микроорганизмов:
Лаборатория микробиологии;
Лаборатория генетики и биохимии микроорганизмов;
Лаборатория биотехнологии;
Биобанк промышленных микроорганизмов;
ТОО «Научно-аналитический центр «Биомедпрепарат»:
Лаборатория мониторинга.
ТОО «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»:
лаборатория клеточной биотехнологии;
лаборатория технологии культивирования микроорганизмов;
лаборатория диагностики инфекционных заболеваний;
лаборатория коллекции микроорганизмов;
лаборатория профилактики инфекционных болезней;
лаборатория микробиологии;
лаборатория молекулярной биологии и генной инженерии;
лаборатория мониторинга инфекционных заболеваний;
лаборатория фитосанитарной безопасности;
лаборатория контроля технологии биопрепаратов;
лаборатория технологии готовых форм биопрепаратов, цех по производству изделий медицинского назначения;
лаборатория особо опасных инфекционных заболеваний.
ТОО «Национальный научный центр особо опасных инфекций имени Масгута Айкимбаева»:
Лаборатория чумы;
Лаборатория холеры;
Лаборатория зоонозных бактериальных инфекций;
Лаборатория природно-очаговых вирусных инфекций;
Лаборатория доклинических исследований с виварием;
Лаборатория эпизоотологии особо опасных инфекций с музеем и инсектарием;
Международный тренинговый центр;
Лаборатория коллекции микроорганизмов;
Лаборатория рабочей коллекции микроорганизмов;
Отдел биолого-технологического контроля с испытательной лабораторией.
TOO «OtarBioPharm»:
Лаборатория микробиологии;
Лаборатория химического контроля;
Лаборатория биологического контроля.